这段Python代码是如何从特征数据中挖掘高风险人群的核心组合并生成可视化画像的?

以下是给定 Python 代码每行的详细作用: ```python import pandas as pd, numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from itertools import combinations ``` - 导入 `pandas` 库并将其别名为 `pd`,用于数据处理和分析;导入 `numpy` 库并别名为 `np`,用于数值计算;导入 `matplotlib.pyplot` 库并别名为 `plt`,用于数据可视化;从 `itertools` 模块导入 `combinations` 函数,用于生成组合[^1]。 ```python feature_file = '问题二_特征构建结果.xlsx' strat_file = '问题二_三级风险分层结果.xlsx' out_file = '问题二_核心组合画像.xlsx' PLOT_FILE_1 = '问题二_高风险核心组合画像图.png' PLOT_FILE_2 = '问题二_画像特征热力图.png' ``` - 定义文件路径变量,分别存储特征构建结果文件、三级风险分层结果文件、输出的核心组合画像文件以及两个绘图文件的文件名[^1]。 ```python plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei', 'Microsoft YaHei', 'Arial Unicode MS', 'DejaVu Sans'] plt.rcParams['axes.unicode_minus'] = False plt.rcParams['figure.facecolor'] = 'white' plt.rcParams['axes.facecolor'] = 'white' GRID_COLOR = '#D9E2EC' BAR_COLOR = '#4C78A8' TEXT_COLOR = '#2D3142' HEAT_CMAP = LinearSegmentedColormap.from_list('portrait_blue', ['#F7FBFF', '#BFD3E6', '#6BAED6', '#2171B5']) ``` - 设置 `matplotlib` 的字体,以支持中文显示,同时避免负号显示为方块;设置图形和坐标轴的背景颜色为白色;定义网格颜色、条形图颜色、文本颜色;创建一个线性分段颜色映射 `HEAT_CMAP` 用于热力图[^1]。 ```python data = pd.read_excel(feature_file, sheet_name='建模数据') features = pd.read_excel(feature_file, sheet_name='特征清单')['特征名'].dropna().astype(str).tolist() ``` - 从 `feature_file` 文件的 '建模数据' 工作表中读取数据到 `data` 变量;从同一文件的 '特征清单' 工作表中读取 '特征名' 列,去除空值,转换为字符串类型后存储为列表到 `features` 变量[^1]。 ```python grade = pd.read_excel(strat_file, sheet_name='全样本分层')[['idx','三级风险']] df = data.merge(grade, left_index=True, right_on='idx', how='inner') ``` - 从 `strat_file` 文件的 '全样本分层' 工作表中读取 'idx' 和 '三级风险' 两列数据到 `grade` 变量;将 `data` 和 `grade` 按照 `data` 的索引和 `grade` 的 'idx' 列进行内连接,结果存储到 `df` 变量[^1]。 ```python priority = [c for c in [ '痰湿质','痰湿质_z','H_痰湿活动耦合','H_痰湿_BMI交互','H_代谢异常负担', '活动量表总分(ADL总分+IADL总分)','活动量表总分(ADL总分+IADL总分)_z', 'BMI','BMI_z','空腹血糖','空腹血糖_z','血尿酸','血尿酸_z', 'TG(甘油三酯)','TG(甘油三酯)_z','TC(总胆固醇)','TC(总胆固醇)_z' ] if c in df.columns] portrait_features = list(dict.fromkeys(priority))[:8] ``` - 筛选出优先特征列表中存在于 `df` 列名中的特征存储到 `priority` 列表;使用 `dict.fromkeys()` 去除重复元素,取前 8 个特征存储到 `portrait_features` 列表,用于后续画像分析[^1]。 ```python if not portrait_features: raise ValueError('未找到可用于画像的特征,请检查“问题二_特征构建结果.xlsx”中的字段。') ``` - 如果 `portrait_features` 列表为空,抛出 `ValueError` 异常,提示未找到可用的画像特征,并建议检查文件字段[^1]。 ```python inverse_keys = ['HDL', '活动量表', 'ADL', 'IADL'] flags = pd.DataFrame(index=df.index) threshold_info = [] ``` - 定义逆向风险关键词列表 `inverse_keys`;创建一个空的 `DataFrame` `flags`,其索引与 `df` 相同;创建一个空列表 `threshold_info`,用于存储阈值信息[^1]。 ```python for c in portrait_features: s = pd.to_numeric(df[c], errors='coerce') if any(k in c for k in inverse_keys): thr = s.quantile(0.25) flags[c + '_风险'] = (s <= thr).astype(int) threshold_info.append([c, '下四分位判定为风险', thr]) else: thr = s.quantile(0.75) flags[c + '_风险'] = (s >= thr).astype(int) threshold_info.append([c, '上四分位判定为风险', thr]) ``` - 遍历 `portrait_features` 中的每个特征: - 将该特征列转换为数值类型,无法转换的设为 `NaN`。 - 如果特征名包含 `inverse_keys` 中的关键词,使用下四分位作为阈值,将小于等于阈值的标记为风险(值为 1),并将相关信息添加到 `threshold_info` 列表;否则使用上四分位作为阈值,将大于等于阈值的标记为风险,同样记录相关信息[^1]。 ```python merged = pd.concat([df[['三级风险','高血脂症二分类标签']].reset_index(drop=True), flags.reset_index(drop=True)], axis=1) high = merged[merged['三级风险'] == '高风险'].copy() flag_cols = flags.columns.tolist() ``` - 将 `df` 中的 '三级风险' 和 '高血脂症二分类标签' 列与 `flags` 按列方向拼接,得到 `merged`;从 `merged` 中筛选出 '三级风险' 为 '高风险' 的数据存储到 `high` 变量;将 `flags` 的列名转换为列表存储到 `flag_cols` 变量[^1]。 ```python rows = [] for r in [2, 3]: for comb in combinations(flag_cols, r): cond = high[list(comb)].all(axis=1) support = cond.mean() if len(high) else 0 support_n = int(cond.sum()) if support_n < max(10, int(0.03 * max(len(high), 1))): continue all_cond = merged[list(comb)].all(axis=1) conf = merged.loc[all_cond, '高血脂症二分类标签'].mean() if all_cond.sum() else 0 rows.append([' + '.join(comb), support_n, support, conf]) ``` - 生成 `flag_cols` 中元素的 2 个和 3 个元素的组合: - 对于每个组合,检查 `high` 数据集中该组合对应的列是否都为 `True`,得到条件 `cond`。 - 计算支持度 `support` 和支持度对应的样本数 `support_n`。 - 如果支持度对应的样本数小于 10 或者小于高风险样本数的 3%,则跳过该组合。 - 在 `merged` 数据集中检查该组合对应的列是否都为 `True`,计算置信度 `conf`。 - 将组合信息、支持度样本数、支持度和置信度添加到 `rows` 列表中[^1]。 ```python portrait_df = pd.DataFrame(rows, columns=['核心组合','高风险样本数','支持度','置信度']) if len(portrait_df): portrait_df = portrait_df.sort_values(['支持度','置信度'], ascending=False).head(15) ``` - 将 `rows` 列表转换为 `DataFrame` `portrait_df`;如果 `portrait_df` 不为空,按照支持度和置信度降序排序,取前 15 行[^1]。 ```python profile_rate_df = merged.groupby('三级风险', observed=False)[flag_cols].mean().T if len(merged) else pd.DataFrame() ``` - 如果 `merged` 不为空,按照 '三级风险' 分组,计算 `flag_cols` 中各列的均值,并进行转置,结果存储到 `profile_rate_df`;否则 `profile_rate_df` 为空 `DataFrame`[^1]。 ```python with pd.ExcelWriter(out_file) as w: pd.DataFrame({'画像变量': portrait_features}).to_excel(w, sheet_name='画像变量', index=False) pd.DataFrame(threshold_info, columns=['变量','风险判定方式','阈值']).to_excel(w, sheet_name='风险判定阈值', index=False) portrait_df.to_excel(w, sheet_name='高风险核心组合', index=False) profile_rate_df.to_excel(w, sheet_name='各风险层标记率') ``` - 使用 `pd.ExcelWriter` 将画像变量、风险判定阈值、高风险核心组合和各风险层标记率分别保存到 `out_file` 的不同工作表中,不保存索引[^1]。 ```python if len(portrait_df): top_df = portrait_df.head(10).iloc[::-1].copy() fig, ax = plt.subplots(figsize=(11, max(5, 0.55 * len(top_df) + 1.5))) color_scale = plt.cm.Blues(np.linspace(0.45, 0.9, len(top_df))) bars = ax.barh(top_df['核心组合'], top_df['支持度'], color=color_scale, edgecolor='white', linewidth=1.2) ax.set_xlabel('支持度(在高风险组内出现比例)') ax.set_ylabel('核心组合') ax.set_title('问题二:高风险核心组合画像', fontsize=13, fontweight='bold') for rect, spt_n, conf in zip(bars, top_df['高风险样本数'], top_df['置信度']): ax.text(rect.get_width(), rect.get_y() + rect.get_height()/2, f' 样本数={int(spt_n)}, 置信度={conf:.2%}', va='center', fontsize=9, color=TEXT_COLOR) ax.grid(axis='x', linestyle='--', alpha=0.35, color=GRID_COLOR) fig.tight_layout() fig.savefig(PLOT_FILE_1, dpi=300, bbox_inches='tight') plt.close(fig) ``` - 如果 `portrait_df` 不为空: - 取 `portrait_df` 的前 10 行并倒序存储到 `top_df`。 - 创建一个画布和坐标轴,设置图形大小。 - 生成颜色渐变列表 `color_scale`。 - 绘制水平条形图展示高风险核心组合的支持度,设置条形图颜色、边框和宽度。 - 设置坐标轴标签和标题。 - 在每个条形图上添加样本数和置信度信息。 - 设置 x 轴网格线。 - 调整布局,保存图像到 `PLOT_FILE_1`,关闭画布[^1]。 ```python if not profile_rate_df.empty: show_df = profile_rate_df.copy() cols = [c for c in ['低风险', '中风险', '高风险'] if c in show_df.columns] show_df = show_df[cols] fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, max(5, 0.5 * len(show_df) + 1.5))) im = ax.imshow(show_df.values, aspect='auto', cmap=HEAT_CMAP, vmin=0, vmax=max(1e-9, np.nanmax(show_df.values))) ax.set_xticks(range(len(show_df.columns))) ax.set_xticklabels(show_df.columns) ax.set_yticks(range(len(show_df.index))) ax.set_yticklabels(show_df.index) ax.set_title('问题二:画像特征在各风险层中的风险标记率', fontsize=13, fontweight='bold') for i in range(show_df.shape[0]): for j in range(show_df.shape[1]): val = show_df.iloc[i, j] txt_color = 'white' if val >= 0.55 * np.nanmax(show_df.values) else TEXT_COLOR ax.text(j, i, f'{val:.1%}', ha='center', va='center', fontsize=9, color=txt_color) cbar = fig.colorbar(im, ax=ax, fraction=0.046, pad=0.04) cbar.set_label('风险标记率') fig.tight_layout() fig.savefig(PLOT_FILE_2, dpi=300, bbox_inches='tight') plt.close(fig) ``` - 如果 `profile_rate_df` 不为空: - 复制 `profile_rate_df` 到 `show_df`,筛选出 '低风险'、'中风险'、'高风险' 列。 - 创建画布和坐标轴,设置图形大小。 - 绘制热力图展示画像特征在各风险层的风险标记率,设置颜色映射、最小和最大颜色值。 - 设置坐标轴刻度和标签,以及标题。 - 在热力图每个格子上添加具体的标记率信息,根据标记率设置文本颜色。 - 添加颜色条,设置颜色条标签。 - 调整布局,保存图像到 `PLOT_FILE_2`,关闭画布[^1]。 ```python msg = f'完成:{out_file}' if len(portrait_df): msg += f',并生成 {PLOT_FILE_1}' if not profile_rate_df.empty: msg += f'、{PLOT_FILE_2}' print(msg) ``` - 定义消息字符串 `msg`,表示处理完成并输出结果文件;如果 `portrait_df` 不为空,添加生成的高风险核心组合画像图信息;如果 `profile_rate_df` 不为空,添加生成的画像特征热力图信息;最后打印消息[^1]。

创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考

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