这段Python代码是怎么一步步构建中医体质与代谢特征的?

以下是给定 Python 代码在机器学习流程里每行代码的具体作用: ```python import os, pandas as pd, numpy as np ``` 导入所需的库,`os` 用于文件和目录操作,`pandas` 用于数据处理和分析,`numpy` 用于数值计算,这些库在数据预处理和特征工程阶段起着重要作用,是后续数据操作的基础[^1]。 ```python #读取指定文件 q1_file = '共同结果整合.xlsx' outfile = '问题二_特征构建结果1.xlsx' df = pd.read_excel('数据(已清洗).xlsx') ``` - `q1_file` 设定了可能包含关键指标信息的文件。 - `outfile` 定义了最终输出文件的名称。 - `df` 使用 `pandas` 的 `read_excel` 函数读取已清洗的数据文件,将其加载到 `DataFrame` 中,这是数据准备阶段的第一步,为后续的数据处理和特征构建提供数据来源。 ```python #初始化一个空列表,用于存储关键指标 features = [] ``` 创建一个空列表 `features`,用于存储后续筛选和构建的特征,在特征工程阶段用于收集有用的特征。 ```python #读取工作表'关键指标',去除空值,转为字符串列表 if os.path.exists(q1_file): xls = pd.ExcelFile(q1_file) if '关键指标' in xls.sheet_names: features = pd.read_excel(q1_file, sheet_name='关键指标')['关键指标'].dropna().astype(str).tolist() elif '建模特征' in xls.sheet_names: features = pd.read_excel(q1_file, sheet_name='建模特征')['建模特征'].dropna().astype(str).tolist() ``` - 检查 `q1_file` 是否存在。 - 如果存在,创建 `ExcelFile` 对象读取文件。 - 若文件中有 '关键指标' 工作表,读取该工作表中的 '关键指标' 列,去除空值并转换为字符串列表赋值给 `features`;若没有 '关键指标' 工作表但有 '建模特征' 工作表,则读取 '建模特征' 列进行相同操作。这一步是从外部文件中获取可能的特征信息,属于特征选择的一部分。 ```python # 3) 加入痰湿质特征 tan_raw = '痰湿质' if '痰湿质' in df.columns else None tan_z = '痰湿质_z' if '痰湿质_z' in df.columns else None tan_col = tan_z or tan_raw if tan_col and tan_col not in features: features = [tan_col] + features ``` - 检查 `df` 中是否存在 '痰湿质' 或 '痰湿质_z' 列,优先选择 '痰湿质_z'。 - 如果存在且该列不在 `features` 列表中,则将其添加到 `features` 列表的开头,进一步丰富特征集合。 ```python # 4) 构造衍生特征 # 活动总分 act_raw = '活动量表总分(ADL总分+IADL总分)' if '活动量表总分(ADL总分+IADL总分)' in df.columns else None act_z = '活动量表总分(ADL总分+IADL总分)_z' if '活动量表总分(ADL总分+IADL总分)_z' in df.columns else None act_col = act_raw or act_z ``` - 检查 `df` 中是否存在 '活动量表总分(ADL总分+IADL总分)' 或 '活动量表总分(ADL总分+IADL总分)_z' 列,优先选择 '活动量表总分(ADL总分+IADL总分)_z',为后续衍生特征的构建做准备。 ```python # BMI bmi_raw = 'BMI' if 'BMI' in df.columns else None bmi_z = 'BMI_z' if 'BMI_z' in df.columns else None bmi_col = bmi_raw or bmi_z ``` - 检查 `df` 中是否存在 'BMI' 或 'BMI_z' 列,优先选择 'BMI_z',同样是为衍生特征构建准备。 ```python # 痰湿-活动耦合 if tan_col and act_col: df['H_痰湿活动耦合'] = df[tan_col] / (df[act_col].replace(0, np.nan) + 1e-6) features.append('H_痰湿活动耦合') ``` - 如果 `tan_col` 和 `act_col` 都存在,则计算 'H_痰湿活动耦合' 列,通过 `tan_col` 列的值除以 `act_col` 列的值(处理了除零问题)得到新的特征。 - 将该新特征添加到 `features` 列表中,属于特征工程中的特征构造步骤。 ```python # 痰湿-BMI 交互 if tan_col and bmi_col: df['H_痰湿_BMI交互'] = df[tan_col] * df[bmi_col] features.append('H_痰湿_BMI交互') ``` - 如果 `tan_col` 和 `bmi_col` 都存在,则计算 'H_痰湿_BMI交互' 列,通过 `tan_col` 列的值乘以 `bmi_col` 列的值得到新特征。 - 将该新特征添加到 `features` 列表中,也是特征构造的一部分。 ```python # 代谢异常负担:基于 z 值阈值构造 risk_positive = [c for c in ['BMI_z','空腹血糖_z','血尿酸_z','TG(甘油三酯)_z','TC(总胆固醇)_z','LDL-C(低密度脂蛋白)_z'] if c in df.columns] risk_negative = [c for c in ['HDL-C(高密度脂蛋白)_z','活动量表总分(ADL总分+IADL总分)_z'] if c in df.columns] df['H_代谢异常负担'] = 0 for c in risk_positive: df['H_代谢异常负担'] += (pd.to_numeric(df[c], errors='coerce') >= 1).astype(int) for c in risk_negative: df['H_代谢异常负担'] += (pd.to_numeric(df[c], errors='coerce') <= -1).astype(int) features.append('H_代谢异常负担') ``` - 筛选出 `df` 中存在的正向和负向风险指标列。 - 初始化 'H_代谢异常负担' 列为 0。 - 通过遍历正向和负向风险指标列,根据阈值条件计算 'H_代谢异常负担' 列的值。 - 将该新特征添加到 `features` 列表中,进一步丰富特征集合。 ```python features = list(dict.fromkeys([f for f in features if f in df.columns])) use_cols = features + ['高血脂症二分类标签'] data = df[use_cols].apply(pd.to_numeric, errors='coerce').dropna() ``` - 去除 `features` 列表中重复的元素,并筛选出 `df` 中存在的列。 - 将 `features` 列表和 '高血脂症二分类标签' 列组合成一个新的列名列表 `use_cols`。 - 从 `df` 中选取 `use_cols` 列的数据,将数据转换为数值类型(无法转换的置为 `NaN`),并去除包含 `NaN` 的行,完成数据的预处理,得到可用于建模的数据集。 ```python with pd.ExcelWriter(outfile) as w: data.to_excel(w, sheet_name='建模数据', index=False) pd.DataFrame({'特征名': features}).to_excel(w, sheet_name='特征清单', index=False) ``` 使用 `pd.ExcelWriter` 创建一个 Excel 写入对象 `w`,将处理好的 `data` 数据写入到 `outfile` 文件的 '建模数据' 工作表中,不写入行索引;将 `features` 列表转换为 `DataFrame` 并写入到 '特征清单' 工作表中,不写入行索引,保存数据和特征信息,为后续的建模阶段做准备。 ```python print(f'完成:{outfile}') ``` 打印完成信息,显示输出文件名,告知用户数据处理和特征构建任务已完成。

创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考

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